MES系統過程管理是指監控生產過程和自動修正生產中的錯誤并提高加工活動的效率和質量，或者向用戶提供糾正錯誤并提高在線行為的決策支持。過程管理是一個內部操作，它的焦點集中在被監控或被控制的機器上，它們通過跟蹤連續的操作來跟蹤整個生產處理過程。生產過程控制應包括報警管理以保證企業員工意識到加工過程的變化。生產過程管理的數據交換是在智能設備和制造執行系統之間的一個接口中進行的。
生產制造的過程控制與調度管理牽扯到生產進度的動態更新、生產計劃實施調度、生產數據的實時采集和車間異常的實時反饋。而生產過程管理控制指引制造過程，對產品各工序的生產、檢驗、維修以及交付過程進行控制和指引，在提高操作效率的同時減少作業操作錯誤的出現，以效益為目標，強化生產過程的事前、事中管理。實時監控生產，實現對生產過程的精細化管理和控制。
長沙MES系統廠商對生產過程的控制管理，圍繞著工單單板、部品條碼打印，SMT備料上料、制造過程采集與控制、在線維修、產品報廢、產品隔離、工單管控、作業指導書查閱和過程相關看板的管理。
企業接到生產任務工單以后，會由計劃員進行排產發布，安排在什么時間、什么工序、哪條產品線、何時完成交貨等。小批量、品種單一的工單，人工還能應付，但是面對企業大批量，品種復雜多樣的情況下，人工肯定無法滿足需求，這時候，就要考慮上系統了。因此，企業不是隨便的上系統，而是要有一定的規模，不然會得不償失。
在分配好生產任務后，MES指導物料員、庫房管理員及時的進行揀料、備料和上料。同時，指導生管對生產人員、設備調試、產品條碼工單的打印，確保生產開工前的準備工作，通過生產工單及文檔管理系統中的作業指導書，生產人員就具備了生產的條件，可以擼起袖子加油干了。
生產過程中，長沙MES系統能夠對之前開工準備的條碼和工單，進行生產制造過程信息的采集，之后，采集到的數據將與工單、工藝路徑及參數、物料、質量等信息進行相互驗證，起到物料防錯、工序防錯防漏、工藝防錯的作用，同時也將采集到的生產及質量信息實時反饋到系統的各看板、SPC和統計報表中，使得管理者在第一時間掌握車間的物料、生產進度、質量情況，為管理者的決策提供數據支持。